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CRISPR interference或CRISPR-on是利用去核酸酶活性Cas9 (dCas9)與轉錄效應子(transcription effector)融合蛋白和多個特異引導RNA(gRNA)--dCas9融合系統,阻礙或激活靶基因轉錄的技術(圖)。劉東課題組于3月27日在線(Cell Research)發表題為“Regulation of transcriptionally active genes via the catalytically inactive Cas9 in C. elegans and D. rerio”研究論文,首次将dCas9融合系統用于多細胞生物(斑馬魚和線蟲),實現對靶基因表達的原位調控。
該融合系統可有效修飾斑馬魚内耳發育和線蟲抗逆反應相關基因表達。該方法不僅适用于蛋白編碼基因表達調節,理論上也可用于非編碼RNA表達、特殊DNA位點修飾的調控等,且其脫靶負效應低于傳統方法。
dCas9融合系統圖
紅色:CRISPR-on 橘色:CRISPRi 靶基因:蛋白編碼基因。
課題組博士生隆例江(PTN)、郭紅和姚頔為該文的共同第一作者。劉東研究員和劉朋朋博士為通訊作者。本研究得到國家自然科學基金委,科技部973項目,國家生物膜及膜生物工程重點實驗室,教育部細胞與增殖重點實驗室,北大清華生命科學聯合中心等單位的資助。
文章鍊接:
http://www.nature.com/cr/journal/vaop/ncurrent/full/cr201535a.html