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無義突變是發生在mRNA編碼區上的突變,在人類疾病相關的單堿基突變中占比約20%,會導緻提前終止密碼子(Premature Termination Codon,PTC)的産生,最終導緻蛋白産物截短和功能缺失。
2024年3月6日,北京大學伊成器課題組在Nature Biotechnology雜志在線發表“Near-cognate tRNAs increase the efficiency and precision of pseudouridine-mediated readthrough of premature termination codons”研究論文。該研究發現,通過過表達近同源tRNA(near-cognate tRNA),能夠影響假尿苷(Ψ)化PTC的翻譯過程,顯著提高RESTART系統的通讀效率及無義突變的修複精準性。這一工作是對課題組前期發展的RESTART技術(Mol Cell., 2023, 83, 139-155)的一次重要升級,該技術最近剛剛被Molecular Cell雜志評為2023年度最佳技術之一。在本工作中,研究人員在篩選PTC位點的所有近同源tRNA後,将提升效果最佳的近同源tRNA與現有編輯效率最高的RESTART v2系統(gsnoRNA+DKC1 iso3)組合,發展了RESTART v3系統(圖一),實現了平均~5倍的PTC通讀效率提升。RESTART v3系統在囊性纖維化(Cystic Fibrosis)和粘多糖症(Hurler Syndrome)的疾病細胞模型中有效地實現了無義突變的功能修複,且脫靶Ψ編輯不會引起RNA編碼信息及基因表達水平的變化,tRNA的過表達也不影響細胞整體tRNA表達水平。
圖一、RESTART v3技術示意圖
綜上所述,近同源tRNA的過表達顯著提高了RESTART系統的編輯效率及無義突變修複精準度,提升了RESTART系統在疾病治療中的應用潛力。利用近同源tRNA與PTC中Ψ的堿基配對特性,RESTART v3系統從mRNA層面上有效地拓展了RNA單堿基編輯類型,并且避免了脫靶修飾導緻的遺傳信息改變,為新型RNA堿基編輯器的發展提供了新的策略與方向。
beat365官方网站、核糖核酸北京研究中心伊成器教授為該論文的通訊作者,課題組博士研究生羅楠、博士後黃強、博士董利婷(已畢業)為共同第一作者。該工作得到北京市教委、科委、農業部和國家自然科學基金委等的資助。
全文鍊接: https://www.nature.com/articles/s41587-024-02165-8